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AI

Medical Image Registration

  • Registration
    - 다른 각도나 크기, 위치에 있는 두 영상을 매칭시켜주는 영상 정합 기법
    MRI Registration 예시 (https://3dqlab.stanford.edu/image-registration/)

    - Linear한 방식과 non-linear(Deformable)한 방식을 사용함 ▶ Non-linear한 방식을 위해 deep-learning 활용

 

Linear 방식 vs Non-Linear 방식 (https://colah.github.io/posts/2014-03-NN-Manifolds-Topology/)

 

  • Registration의 목적
    1) 시계열적 정보 분석 ▶ 환자의 질병 경과 파악
         - 동일한 환자가 동일한 모달을 사용하는 경우
    2) 여러개의 모달 분석 ▶ 고차원적인 병변 분석
         - 동일한 환자가 여러 개의 모달을 사용하는 경우 (ex. T1, T2, Flair 등)
    3) Annotation 자동화 라벨링비용 및 시간 절감
         - 다양한 환자데이터를 동일한 모달에서 사용하는 경우


  • Registration 방식
    1) Linear Registration
        - Affine, Shear, Translation, Rotation, Scaling 등
    2) Non-Linear Registration (Deformable Registration)
        - Elastic type model, statistical parametric mapping, b-splines, discrete method, demons, NiftyReg, ANT's SyN
          ▶ 위 방식들은 모두 energy function을 optimize하는 방식으로 연산시간이 매우 오래걸림

    - Deep learnig 기반의 deformable registration은 ground-truth에 의존하기 때문에 한계가 있어
      Unsupervised learning을 활용한 연구가 주로 진행 중


  •  
  • Deformable Registration (Non-linear Registration)
    - 선형적이지 않은 뒤틀린 정보를 정합할 수 있는 유연한 registration 기법으로 보다 공간적인 registration 정보를 얻기 위해 활용 


  • Deformable Registration의 장점 및 한계
    ○ 장점
        - linear한 registration에서 다루지 못하는 변환 가능
        - 대부분의 이미지 정합에서 높은 성능
     한계
        - Computational resource가 많이 소요되며, 매우 느림실제 사용이 어려움
        - Computational resource 한계를 개선하기 위해 deep-learning 기반의 deformable registration 기법이 연구 중


  • Medical Data의 Deep-learing 활용을 위한 방안
    - Transfer Learning(전이학습)
    - Weakly Supervised Learning
    - Self-supervision
    - Semi or Unsupervised Learning

 


 

  • Unsupervised Learning 기반의 Deformable Registration (VoxelMorph)
    - Ground-truth 없이 learning을 진행하여 resource 절감이 가능함
    - VoxelMorph: Unsupervised Learning의 base-line 모델

VoxelMorph 모델구조

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